《聖經》3次記載耶穌哭了，分別在〈路19:41, 約11:35, 來5:7〉。耶穌下橄欖山，將近耶路撒冷，看見城，就為她哀哭：「巴不得妳在這日子知道關係妳平安的事；無奈這事現在是隱藏的，叫妳的眼看不出來；因為日子將到，妳的仇敵必築起土壘，周圍環繞妳，四面困住妳，並要掃滅妳和妳裡頭的兒女，連一塊石頭也不留在石頭上，因妳不知道眷顧妳的時候。」（路19:41-44）這話呼應了之前主耶穌所說的：「耶路撒冷阿！耶路撒冷阿！妳常殺害先知，又用石頭打死那奉差遣到妳這裡來的人。我多次願意聚集妳的兒女，好像母雞把小雞聚集在翅膀底下，只是你們不願意。看哪，你們的家成為荒場留給你們。」（路13:34-35）

耶穌在拉撒路墳墓前哭了，〈約11:35〉「ἐδάκρυσεν ὁ Ἰησοῦς｜Jesus wept｜耶穌哭了。」這是全本《聖經》最短的一節。那時，猶太人就說：「你看他愛這人是何等懇切。」（約11:36）因為朋友拉撒路死了，所以耶穌哭嗎？如果拉撒路不能復活，那才要哭；如果死了還要復活，而且是耶穌自己給他復活的，耶穌為什麼要哭？所以那些人猶太人完全誤會了，他們不明白耶穌為什麼哭。耶穌是因為這些硬著心的法利賽人、律法師、猶太人，就因為祂要行的神蹟，他們就定意從那天開始決定殺祂，（參 約11:53）所以耶穌哭。